《沉默》改编自著名日本作家远藤周作的同名小说。故事发生在德川幕府时代禁教令下长崎附近的小村子，一个葡萄牙耶稣会的教士偷渡到日本传教，并调查恩师因遭受「穴吊」酷刑而宣誓弃教一事，因为这事在当时欧洲人的眼中，不只是个人的挫折，同时也是整个欧洲信仰、思想的耻辱和失败。在传教与寻访的过程中，信仰与反叛、圣洁与背德、强权与卑微、受难与恐惧、坚贞与隐忍、挣扎与超脱……所有的两难情境都面临了，逼迫着他对基督的信...

曾经名震加贺藩的剑术师傅的斑目久太郎（北村一辉饰），被人称作“斑鬼”。然而他早已威风不再，为求生计而告别妻女，独自来到江户寻找新的门庭。人生最落魄的时候，斑目盘桓在江户的长屋中，考糊雨伞勉强度日。这一天，几个流氓找上门来。对方来自米泽一家，米泽一家的老大爱狗如命，三十年前曾和亲猫派的相泽一家结下梁子。如今新的奉行是亲猫派，甚至因此要和相泽结下猫亲家。为了避免被倾轧的命运，米泽一方花五两雇佣斑目杀掉...